آیتالله میلانی بیشتر عمر خود را در عراق گذارند و در آنجا از درس علمایی چون شیخ الشریعه اصفهانی، آقا ضیا عراقی و میرزا محمد حسین نائینی بهره برد، وی از سال ۱۳۳۲ش در مشهد ساکن شد،آیت الله سید علی خامنهای رهبر جمهوری اسلامی ایران مدتی نزد وی شاگردی کرد.
